弊社は、中国滞在中に世界最大遺伝学研究所BGI（深圳）の関係者と、カイジを使っての中国との共同研究開始に当たり、意見交換を行いました。
そこで、世界最大遺伝学研究所BGI（深圳）についての記事を転載させていただきます。
中国のゲノム研究所、「究極のシークエンサー」の開発に着手──米市場を巡る競争が激化
世界最大規模のゲノム研究所を擁する中国企業 「BGI」が、米西海岸の2カ所に新たな研究拠点を発足した。さらには独自の次々世代シークエンサーの開発を進めることが発表されている。シークエンサー を製造する米企業イルミナの最大顧客だったBGIが競争相手に転じることになり、激しい開発競争が始まった。
TEXT BY MEGAN MOLTENI
TRANSLATION BY TOMOYUKI MATOBA/GALILEO
世界最大の遺伝学研究所があるのは、ハーヴァードでもスタンフォードでも、米国立衛生研究所（NIH）でもない。香港国際空港から約30kmの活気に満ちた中国の大都市、深圳にそれはある。BGI（華大基因、旧・北京華大基因研究中心）は、これまで大小さまざまな動植物のDNA配列を解読してきた。キビ、イネ、ジャイアントパンダ、40品種のカイコ、 SARSウイルス、さらには「イヌク（Inuk）」と名付けられた4,000年前の古代人まで──（グリーンランドで冷凍状態で発見された毛髪が利用された）。
ワシントン大学以外にも、複数の米研究機関がBGIと提携を結んでいる。2017年5月17日、BGIはシアトルとサンノゼの2カ所に拠点を置く西海岸イノヴェイションセンターの発足を発表した。シアトル本部はプレシジョン・メディシン（精密医療：個人の遺伝子情報などを含む詳細な情報を基に、より精密な対応を行う医療）に焦点を当て、ワシントン大学以外に、アレン脳科学研究所、ビル＆メリンダ・ゲイツ財団、ワシントン州立大学と共同研究を実施する。
一方、サンノゼには以前からBGIの研究所があり、100人超の職員を抱える。ここでBGIは今後、次々世代シークエンサー技術の開発に着手する。米国のシークエンサー大手イルミナ（Illumina）がこれまで独占していた分野だ。
BGI の創設者兼代表、汪建（Jian Wang）は「目的は、中国と米国の研究者間の協力を促進することです」と語る。「より緊密に連携し、両国の医療界に病気の予防や治療の新たなツールを提 供したいと考えています」。シアトルの研究拠点で行われているプロジェクトには、癌のバイオマーカーの特定や、ヒト脳細胞のマッピングなどがある。また、大規模な公衆衛生研究の発足も議論されている。これらの共同研究の将来には、多くの研究者が大いに期待していると言う。
脱米国依存を目指す中国、中国の追随を許さぬ米国
一方、サンノゼで際立つのは、協力よりもむしろ対立だ。
7 年前、中国をDNA解析の超大国にするという使命を負ったBGIはまず、当時世界最速のシークエンサーであった「イルミナHiSeq200」を128台購入した。これによりBGIはイルミナの最大顧客となり、一夜にして業界の話題をさらった。2014年までに、BGIは世界のゲノムデータの少なくとも4分 の1を生み出すまでになっており、これは地球上のどの研究機関よりも多い量である。BGIのシークエンス能力は現在も世界一だ。しかし、ここ数年はマシン の型落ちにより、イルミナや中国の競合相手であるノヴォジーン（Novogene）が送り出す、より新しく、速く、安く、強力なシークエンサーの台頭を許 している。
そこでBGIは商売敵から機器を買うかわりに、自ら次世代シークエンサーを開発する道を選んだ。2013年、BGIはイルミナ の競合となる米国企業コンプリート・ゲノミクスを買収したが、最初の勝負は黒星に終わる。BGIは、わずか3件の受注のあと販売を中止したのだ。そして BGIは、15年後半にシークエンサー「BGISEQ-500」を発表。同社によると、ヒトゲノム全体の解析を600ドルで完了できるもので、この価格は イルミナの同等製品と比べて40パーセントも安い。
中国の国家食品薬品監督管理局（CFDA）は2016年、BGI製シークエンサーの医療器具申請を承認し、臨床遺伝子検査での使用を許可した。BGIはすでにこのシークエンサーを提携研究機関などに出荷済みだ。BGIのグローバル研究主幹、 何亦武（Yiwu He）によれば、まだ米国での販売実績はないものの、BGIは将来の米国市場進出を見据えて生産能力の向上に努めている。「もちろん、米国市場には関心をもっています」と、同氏は言う。
し かし、まずは自陣の態勢を整える必要があるだろう。「顧客の需要を満たすため、まだしばらくはイルミナのシークエンサーを使い続けるでしょう。けれども今後は、当社の研究施設に自社機器がどんどん増えていきます」と、何は言う。イルミナ依存の脱却がいつ完了するのか、どれほどの規模になるのかについて何は言及せず、サンノゼの研究開発部門が入れ替えの中心的役割を担っていると述べるにとどめた。
BGIはDNAナノボールを利用したクラスター解析システムを開発中で、これによりヒトゲノム解析の価格を200ドルにまで下げられるとしている。一方のイルミナは2017年1月、新機種「NovaSeq」を発表し、100ドルゲノム（わずか１万円強）解析の実現を約束した。BGIがカリフォルニアの拠点を強化した今、イルミナの目と鼻の先で激しい開発競争が繰り広げられることになる。
や やこしいことに、BGIはいまもイルミナの顧客でありながら、競合相手としての存在感を増している。イルミナのジェイ・フラットレー執行役会長は、2社の 関係はますます複雑化しているため、詳細については一切コメントできないとしつつも、BGIが解析ソフトやシークエンス技術の向上によってこの分野の発展 を推進していることに関しては、いいことばかりだと話す。「ヒトゲノムから臨床的に意義のある情報を引き出すには、まだまだ課題が山積みです」と、フラッ トレー会長は言う。
中国政府と米政府は、いずれもゲノム医療に多額の投資を行っている。2016年3月、オバマ前大統領が2億1,500万ドルを投じて100万人の米国民のゲノム解析を実施する計画を発表したほぼ1年後、中国はそれを遥かに上回る数十億ドル規模のゲノムプロジェクトを発表した。同計画によると、今後15年間にBGIを含む3つの研究機関が数百万人の中国国民のゲノムを解析し、費用は政府が負担するという。これほど膨大なデータとなれば、次々世代シークエンサーが大いに役立つのは間違いない。
https://wired.jp/2017/07/05/chinese-genome-giant-uitimate-sequencer/
より抜粋。